烏海銀行總行內設15個部室，下轄22家支行和1家營業部。烏海銀行不斷優化金融資源的配置，積極拓展發展空間。2008年至2009年先后在阿拉善盟烏斯太鎮和鄂爾多斯棋盤井鎮設立2家支行，標志著烏海銀行實現了從本土經營到跨行政區域經營的歷史性突破。同時，為落實銀監會建設新型農村金融機構，促進社會主義新農村建設的指示精神，烏海銀行發起設立了海南省文昌市、瓊海市以及內蒙古鄂爾多斯市杭錦旗、巴彥淖爾市烏拉特前旗、廣東始興5家村鎮銀行。